次氯酸一般用作漂白剂、氧化剂和消毒剂。

含有次氯酸根的盐被称为次氯酸盐。最广为人知的一种家用次氯酸盐消毒剂是次氯酸钠（NaClO）。次氯酸具有强氧化作用和漂白作用，它的盐类可用做漂白剂和消毒剂，次氯酸盐中最重要的是钙盐，它是漂白粉（次氯酸钙和碱式氯化钙的混合物）的有效成分。漂白粉可由氯气和消石灰反应而制得：3Ca(OH)₂+2Cl₂=Ca(ClO)₂+CaCl₂·xCa(OH)₂·yH₂O+H₂O，在放置漂白粉的地方具有氯气的气味，是因为有一氧化二氯放出的缘故。

在生物学系统中，次氯酸可被视为白细胞例如中性粒细胞和单核细胞产生的毒性最强、丰度最高的氧化剂。次氯酸作为一种极强的氧化剂，可迅速攻击多种生理学相关的分子，包括硫醇、硫醚、胺类、氨基酸、核苷酸、抗坏血酸和多烯酸 。同时，次氯酸可生成反应性非常高的其他氧化剂，例如与H2O2和超氧阴离子反应可分别生成单线态氧和羟基自由基 。

次氯酸作为消毒剂，被广泛用于物体表面、织物等污染物品以及水、果蔬和食饮具等的消毒。除上述用途外，次氯酸还可用于室内空气、二次供水设备设施表面、手、皮肤和黏膜的消毒。

注意事项：

次氯酸应储存于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。库温不超过30℃，相对湿度不超过80%。包装要求密封，不可与空气接触。应与还原剂、酸类、易（可）燃物等分开存放，切忌混储。不宜大量储存或久存。储区应备有合适的材料收容泄漏物。

次氯酸是外用消毒剂，不得口服，置于儿童不易触及处。配制和分装高浓度消毒液时，应戴口罩和手套；使用时应戴手套，避免接触皮肤。如不慎溅入眼睛，应立即用水冲洗，严重者应就医。次氯酸对金属有腐蚀作用，对织物有漂白、褪色作用。金属和有色织物慎用。次氯酸是强氧化剂，不得与易燃物接触，应远离火源。此外，次氯酸的包装应标示相应的安全警示标志。应依照具体产品说明书注明的使用范围、使用方法、有效期和安全性检测结果使用。